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急性髓性白血病中组蛋白 H3K9me2 的全基因组图谱揭示了与大量基因沉默和基因组不稳定位点相关的大染色体结构域
在真核染色质中,DNA 反复盘绕在小碱性蛋白质(组蛋白)的八聚体周围,形成核小体 [1]。染色质结构和组蛋白的翻译后修饰是了解潜在基因表达的关键因素 [2]。由组蛋白翻译后修饰、DNA 甲基化和转录调节因子库的变化引起的基因表达模式的可遗传改变被称为表观遗传变化 [3]。协调细胞从未成熟、增殖状态转变为成熟、分化组织的表观遗传变化是发育过程中的关键事件,调节这些过程的基因是可能导致癌症的 DNA 突变和表观遗传缺陷的常见目标 [4-8]。一个例子是急性髓性白血病 (AML),这是一种高度恶性的造血系统疾病,约占白血病总病例的 30%,在四种主要白血病类型中存活率最低 [9]。 AML 表现为骨髓内的造血过程中断,导致外周血中未成熟的髓细胞数量过多,其分化在不同的早期阶段被阻断或停滞。虽然正常的造血是由细胞外信号传导和内在表观遗传变化共同调节的 [10],但事实上,在 AML 中最常发生突变的基因中 [11],大多数被称为表观遗传染色质调节因子,这表明染色质表观遗传学是导致 AML 以及其他血液系统恶性肿瘤的突变的主要目标 [12]。 虽然 DNA 甲基化和 Polycomb 抑制复合物是与人类白血病相关的研究最多的表观遗传因素之一 [10, 12],但在这项工作中,我们将研究重点放在功能相关的组蛋白修饰、组蛋白 H3 赖氨酸 9 二甲基化 (H3K9me2) 的作用上。 ,在与正常骨髓细胞分化及其中断导致 AML 相关的过程中。这种组蛋白修饰与基因抑制有关 [13],与密切相关的抑制标记组蛋白 H3K9 三甲基化 (H3K9me3) 与组成型着丝粒周围异染色质的关联相反,H3K9me2 标记广泛分布在常染色质中的抑制基因 [14 ] 以及核外围的动态核层相关域 (LAD) [15]。通过基因组分析,H3K9me2 在正常细胞分化过程中显着增加 [16, Read more...