携带t(17;19)(q22;p13)的急性淋巴细胞白血病(ALL)是一种罕见的白血病亚型,预后很差。这种反复出现的易位会产生异常的TCF3-HLF融合,具有独特的基因表达谱和药物敏感性。最近的研究表明,这种亚型的白血病可能是利用抑制BCL-2和通过抑制SRC家族激酶的前B细胞受体的疗法来进行治疗的。然而,这些研究的初步验证显示,对BCL-2和SRC抑制剂的反应存在明显的异质性。因此,我们试图确定其他可能的目标,以克服这种异质性并改善对治疗的反应。

  在免疫缺陷的NSG小鼠中扩增了来自儿童肿瘤学组ALL生物库的一个本地样本和另外四个样本,这些样本都是TCF3-HLF ALL。所有样本都通过RT-PCR和Sanger测序对融合转录本进行了验证。然后用我们的功能性药物筛选法对样本进行询问,该筛选法由对三分之二的酪氨酸激酶组以及其他非酪氨酸激酶途径具有活性的化合物组成,包括RAF/MEK/MAPKs。PI3K/AKT/mTOR、AMPK、ATM、Aurora激酶、CAMKs、CDKs、GSK3a/b、IKK、PKA、PKC、PLK1和RAF以及BCL2家族、BRD4、IDH1/2、Hedgehog、HSP90、NOTCH/g-分泌酶、蛋白酶体、Survivin、STAT3和WNT/b-catenin。使用Agilent SureSelect Strand-Specific RNA Library Preparation Kit在Bravo机器人(Agilent)上对样品进行了测序。所有五个病人的样本都成功地移植到NSG小鼠体内,并进行了体内敏感性测试,以评估疾病负担或生存率。

  三个患者样本被确定为携带I型易位,融合了TCF3的13号外显子和HLF的4号外显子的可变内含子插入。所有三个I型易位产生了不同的融合,因为可变区域内的长度不同。一个样本预测TCF3的截断产物结束于外显子13,可变区域内有一个早期终止密码子。两个患者样本携带相同的II型易位,将TCF3的第12外显子与HLF的第4外显子融合。五个样本的RNA-seq结果发现了其他个别的易位,但都不涉及其他特定的疾病相关病变。我们的药物筛选结果显示,对大多数检测药物的反应存在明显的异质性,包括ABL/SRC抑制剂达沙替尼和BCL-2抑制剂venetoclax。此外,在体内研究中,将动物群组暴露于药物(n=5)、达沙替尼(40mg/kg/天;n=5)、venetoclax(25-100mg/kg/天;n=5)或达沙替尼和venetoclax的组合(n=5),只发现两个样品有治疗效果。有趣的是,对药物筛选结果的审查表明对极光激酶抑制剂过敏。每个样本都在体内进行了车辆(n=5)和alisertib(30mg/kg/day;n=5)的群组测试。所有五个ALL样本都显示出明显的反应(通过Chi Square分析,所有五个样本与各自的车辆对照组相比,P<0.01)。所有动物都能耐受治疗,没有动物因药物治疗而出现明显的血液学毒性。

  我们的结果表明,TCF3-HLF ALL是一个异质性的ALL亚群,具有从TCF3-HLF到其他融合体的不同基因表达模式以及功能性药物反应。用这五个样本在小鼠模型中进行的体内验证表明,与以前发表的报告相比,目前追求的目标如BCL-2和SRC有明显的异质性。最耐人寻味的是,所有用alisertib测试的样本都有明显的体内反应,这表明在这种罕见的、致命的ALL亚型中进行进一步的临床测试有独特的临床前支持。

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