肝脏疾病
整合分析鉴定肝癌预后、诊断、免疫浸润及治疗药物相关枢纽基因
肝癌是全球最常见的癌症之一,也是癌症死亡的原因。目的是通过综合分析阐明有益于肝癌诊断、预后和靶向治疗的新型枢纽基因。 GSE84402、GSE101685 和 GSE112791 从基因表达综合 (GEO) 中过滤。差异表达基因 (DEGs) 使用 GEO2R 进行鉴定。在 DAVID 中分析了 DEG 的 GO 和 KEGG 途径。DEG 的 PPI 和 TF 网络是通过使用 STRING、TRANSFAC 和 Harmonizome 构建的。基于癌症基因组图谱(TCGA)在 UALCAN 中分析了枢纽基因与肝癌预后之间的关系。通过ROC评估hub基因的诊断价值。在TIMER中分析hub基因与肿瘤浸润淋巴细胞之间的关系。在 HPA 中验证了 hub 基因的蛋白质水平。在 DGIdb 中鉴定了中枢基因和药物之间的相互作用。 总共有 108 个上调和 60 个下调的 DEG 富集在 148 个 GO 术语和 20 个 KEGG 阅读更多…